生物の分类

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生物の分类（せいぶつのぶんるい）では、生物を统一的に阶级分类する方法を説明する。分类学、学名、Category:分类学、ウィキスピーシーズも参照のこと。

目次

[编集] 概説

判明している生物の种は、300万から1,000万种である。それぞれの种には学名（属名+种小名または属名+种形容语）がつけられる。学名の前半は属名で、属とはごく类縁関系が近い种をまとめたものである。これらを分类してその分类グループに分类名をつけることが行われている。さらにこの分类を阶层的に（小分类>中分类>大分类etc）体系付けすることで、いろいろな生物グループ同士の类縁関系、ひいては进化の系谱を明らかにしようとする。

分类学は、それぞれの时代において、その当时までに判明した情报に基づいてできるだけ纳得の出来るような分类の体系を模索し続けてきた。リンネの时代には形态を中心に、顕微镜が使われるようになればそこから得られる情报をも利用し、生化学が発达すれば色素なども利用し、常にできるだけ纳得のいく体系が探し求められた。そのため、分类体系は时代と共に変化しつつ、次第に正しい姿に近づいているものと考えられる。20世纪末には遗伝子そのものを参照する分子遗伝学の手法が取り入れられ、多くの分类群において大きな见直しが迫られている。したがって、このような体系は今后も変更を余仪なくされることがままあるはずである。

しかしながら、それぞれの时点において、どれかの体系を采用しなければ文章は作れない。そのため、Wikipediaはそれぞれの群で特定の体系を采用している。したがって、その记述が他の书籍等と异なる场合があること、どちらが正しいかの议论が困难な场合があることを记しておく。

[编集] アリストテレスの分类

どのような分类体系が合理的かは、アリストテレス以来さまざまな工夫がされ、案が出されてきた。 彼の『动物の発生』では动物分类は次のようになる。

  1. 有血动物
    1. 胎生
      1. 人类
      2. 胎生四足类
      3. 鲸类
    2. 卵胎生
      1. 软骨鱼类
    3. 卵生
      1. 鸟类
      2. 卵生四足类
      3. 无足类
    4. 不完全卵生
      1. 鱼类
  2. 无血动物
    1. 不完全卵生
      1. 软体类
      2. 软殻类
    2. 蛆生あるいは自然発生
      1. 有节类
    3. 无性生殖または自然発生
      1. 殻は类
      2. その他

アリストテレスの権威が絶対とされた中世は、この动物分类が支配的であった。

[编集] リンネの分类

近代的な分类法の刷新はリンネから始まった。

リンネは种の学名に二名法（属名と种小名の2语の表す）を采用し、分类を体系づけた。 また、属・种の上位分类として、纲・目を设けて、阶层的な分类体系とした。

现在の生物分类でもこのルールは変わっていないが。リンネの时代に比べると阶层构造はより多段阶となっている（后述）。

しかしリンネの分类自体が现在もそのまま生きているわけではない。例えば、リンネはクジラを鱼类に分类していたがこれは误りであった。 また植物をおしべの本数を元に分类したことは有名だが、现在の植物分类ではこの分类手法は舍てられている。

また、リンネの时代には「进化」の概念がなかったため、リンネの分类はあくまでも形态の类似异同の差异による操作に限られる限界があった。

[编集] 现在の生物分类

以下では现时点で生物分类でほぼ通用に使われている分类体系フレームを记述する。

※ 分类体系はこれまでに述べたように、あくまでも人が扱いやすくするための人为的なものである侧面があることに注意すること。
※ 近年では、さまざまな分野で伝统的な分类体系を系统学の知见を反映させた体系に组替える动きが盛んである。
和名 英名 例：ヒト 例：ローズマリー 例：エノキタケ
界: Kingdom: 动物界 植物界 菌界
门: Phylum/Division: 脊索动物门
（脊椎动物亜门）		 被子植物门 担子菌门
纲: Class: 哺乳纲 双子叶植物纲 菌蕈纲
目: Order: サル目 シソ目 ハラタケ目
科: Family: ヒト科 シソ科 キシメジ科
属: Genus: ヒト属
Homo		 ローズマリー属
Rosemarinus		 エノキタケ属
Flammulina
种: Species: sapiens officinalis velutipes
  • 门は、动物界はPhylum、植物界、菌界はDivisionと使い分ける。
  • 中间的分类が必要なときの阶级名は、その分类単位よりも上位の分类には、大(Megn-)・上(super-)を、下位の分类には、亜(sub-)・下（infra-）・小(Parv-)などの接头语を各阶级の头につけて生成させる。
  • Subfamily（亜科）とGenus（属）の间をさらに细分する必要があるときは、Tribe（族）を使う。
  • Subgenus（亜属）とSpecies（种）の间をさらに细分する必要があるときは、Section（节）を使う。

[编集] 分类名の接尾辞

属より上位の分类名には、植物・藻类・菌类については国际植物命名规约、动物では国际动物命名规约で定められた规则的な接尾辞が付けられている。

分类単位
Taxon		 植物
Plants		 藻
Algae		 菌
Fungi		 动物
Animals
门 Division/Phylum -phyta -phyta -mycota  
亜门 Subdivision/Subphylum -phytina -phytina -mycotina  
纲 Class -opsida -phyceae -mycetes  
亜纲 Subclass -idae -phycidae -mycetidae  
目 Order -ales -ales -ales  
亜目 Suborder -ineae -ineae -ineae  
上科 Superfamily -acea -acea -acea -oidea
科 Family -aceae -aceae -aceae -idae
亜科 Subfamily -oideae -oideae -oideae -inae
族（连） Tribe -eae -eae -eae -ini
亜族（亜连） Subtribe -inae -inae -inae -ina

[编集] 最上位分类の変迁

生物分类の阶层构造の最上位は、伝统的に界(Kingdom)であった。 この界は古代から二界（植物界、动物界）に分けられてきたが、近代に微生物の知见が高まってくると、三界、五界、八界に分ける説などが登场してきた。

[编集] 二界説

リンネが定めた分类法で生物を动物界（动いて饵を采るもの）、と植物界（动物ではないもの）の2界に分类したものである。

[编集] 三界説

19世纪には、ヘッケル(Ernst Heackel)が、动物とも植物ともとれる原始的な生物を3番目の生物界、原生生物界として分离し、动物界、植物界、原生生物界の三界とした。
（また、病原性极小微生物として、ウイルスの存在が认识され始めたのも同时期である。ウイルスは２０世纪にはいると、スタンリーによって结晶化され当时の人々を惊かせた。（タバコモザイクウイルス、1935年）ウイルスは自己増殖性を示すものの命を持たない非生物と定义される）
また后年、五界説が提唱されたあとでの三界説の再提唱というものもあった。すなわち、后生动物界、后生植物界、原生生物界の三界とするもので、真菌类等を原生生物とみなすものである。

[编集] 五界説

五界説は、1959年、ホイタッカー(Robert H. Whittaker)が提唱した分类法で、现在の主流となっている。 细胞核を持たない原核生物をモネラ界として、カビ、キノコなどを菌界として新たに分离し、モネラ界、原生生物界、植物界、菌界、动物界の五界とした。
1980年代に入ると分岐分类学が优势となり、动物界・植物界・菌界はそれぞれより狭义的な分类がふさわしいと考えられるようになる。1982年、マーグリスによって、それまで植物と考えられたすべての藻类、および菌类と考えられた粘菌类、卵菌类を原生生物界へと移す提案がなされた。これにより现在に至る五界説の骨格がほぼ决定した。

[编集] 六界説

五界説のモネラ界をさらに细胞の特性で细菌界、古细菌界に分けたもの。1977年にカール・ウーズが提唱した。

[编集] 八界説

五界説における原生生物というくくりは、植物、菌、动物ではない「その他」的なくくりであって、分类群としては非常に雑多であるという面がある。
これに手をつけたのが、キャバリエ＝スミスである。彼は、原生生物界をクロミスタ界、アーケゾア界、原生动物界に３分し、八界説を提唱した。それぞれ、クロミスタ界はワカメ等の褐藻植物を含む黄色植物やハプト藻类、クリプト藻类などの生物、アーケゾア界はミトコンドリアを持たない生物、原生动物界は动物的単细胞由来のもののうち胚分割しない生物、という分类になる。これによれば、生物は古细菌界、真正细菌界、アーケゾア界、原生动物界、クロミスタ界、植物界、菌界、动物界に分类される。
しかし、しばらくすると、ミトコンドリアを持たない生物はもともと持っていなかったものに加え、退化的にミトコンドリアを丧失したものもあることが指摘され、アーケゾア界というくくりに意义がなくなってきた。

[编集] 三つのドメイン

それまでの分类学では、界をもって最上位の分类群としてきたのだったが、动物界、植物界以外の生物の多様性への认识が深まるにつれ、界の数もしだいに増え、最上位の分类としては捉えることができなくなっていく。 1990年、ウーズは、界より上位の阶层として、ドメイン（超界・域）を设ける提案をする。これによれば、生物界全体は、真核生物、真正细菌、古细菌として分けられる。

[编集] 各界の関连

リンネ
（1735年）
2界説		 ヘッケル
（1894年）
3界説		 ホイタッカー
（1959年）
5界説		 ウーズ
（1977年）
6界説		 ウーズ
（1990年）
3ドメイン説[1]
  原生生物界 モネラ界 真正细菌界 真正细菌域
古细菌界 古细菌域
原生生物界 原生生物界 真核生物域
植物界 植物界 菌界 菌界
植物界 植物界
动物界 动物界 动物界 动物界


[编集] 最新の动向

2000年代初头までは、最新分类としてキャバリエ＝スミスの八界説がよく使われていた。 この八界説はどちらかといえば、それまでの界の枠组みを残しつつ、それまでに得られた系统情报を盛り込んだものである。その一方で、しだいに遗伝子解析の手法も熟练度を増し、系统そのもので分类することが出来るレベルにまでなってくる。
2005年、国际原生动物学会から真核生物の新しい分类体系（Adl.et.al）が提出された。 この分类は、それまでの界の枠组みを廃し、真核生物を6つのスーパーグループに分类するものである。ウィキペディアの各记事でも、これらを界相当の分类として采用している场合が多い。

真正细菌ドメイン 真正细菌
古细菌ドメイン 古细菌
真核生物ドメイン オピストコンタ
アメーボゾア
エクスカバータ
リザリア
アーケプラスチダ
クロムアルベオラータ

2008年现在では、Adl.et.al(2005)を踏袭しながら阶层分类を盛り込むようなものも出てきている。例えば、上述のスーパーグループのうちの４つをまとめて、バイコンタとして単系统性を示すことができるようになった。下表は、近年に见られる分类の一例である。

真正细菌ドメイン 真正细菌界
古细菌ドメイン ユリアーキオータ界
クレンアーキオータ界
真核生物ドメイン オピストコンタ上界 动物界
菌界
アメーボゾア上界 アメーボゾア界
バイコンタ上界 エクスカバータ界
リザリア界
（一次）植物界
ストラメノパイル界
アルベオラータ界
クリプト植物界
ハプト植物界

[编集] 通用分类例

[编集] 原核生物(=モネラ界)

[编集] 真核生物

[编集] 原生生物界

[编集] 植物界

[编集] 菌界

[编集] 动物界

[编集] 分子系统学的分类例

20世纪后半から勃兴した、タンパク质のアミノ酸配列や核酸の塩基配列决定法の技术、そしてそのデータを用いて系统の类縁関系を推定する解析手法の进展に伴って、従来の生物系统分类法は大きな変革を迫られている。特に、これまで他のグループに所属させることができないために一括りに分类されていた、原生生物や藻类、一部の菌类につき系统が大幅に见直されつつある。学问上は二界説ないし五界説は既に瓦解したと言っても过言ではない。ここではキャヴァリエ＝スミス(Thomas Cavalier-Smith)らが中心となって提唱している分子系统学的分类の一例を示す（ただし现生生物のみ）。従来の界、门、纲との集成性は今后の课题である。この分野は现在さらに进展しつつあるため、今后も大小の変更があり得る。

[编集] 参考文献

  1. ^ Woese C, Kandler O, Wheelis M (1990). “Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya（生物の自然机构について：古细菌、细菌、真核生物の3ドメインの提案）.”. Proc Natl Acad Sci U S A 87 (12): 4576-9. PMID 2112744.

[编集] 関连项目

"http://ja.wikipedia.org/wiki/%E7%94%9F%E7%89%A9%E3%81%AE%E5%88%86%E9%A1%9E" より作成